A l'origine créé par l'Akatsuki, le village caché de la Foudre rouge est devenu une puissance indépendante, avec laquelle chaque pays doit désormais compter... ou plutôt "devait". Une catastrophe aux causes encore inconnues a rayé le village de la carte. Tandis que l'Akakage est porté disparu, une poignée de survivants tente de continuer leur oeuvre destructrice en fondant une nouvelle organisation : le Kagen.

Autrefois l'une des cinq grandes puissances du monde shinobi, le village de Kumo a été détruit par l'Akatsuki il y a plusieurs années. Désormais le Pays de la Foudre est une terre désolée qui n'attire plus grand monde, mais continue d'abriter de nombreuses ruines pleines de mystères.

Ce pays est partiellement composé d'une flore pour le moins inhabituelle. Certaines de ses forêts sont normales, mais ailleurs se trouvent des forêts de champignons gigantesques. Le village de Kusa a été détruit par de puissants shinobis : il n'en reste que des ruines, et le pays vit aux dépends des autres !

On ne sait pas grand chose de ce pays, si ce n'est qu'il s'y trouve une cascade géante, qui dissimule l'entrée de Taki, son village caché.

Ce pays où il neige beaucoup n'a jamais été impliqué dans un quelconque conflit international. Cependant, ce pays possède une force militaire puissante, composée non pas de ninjas, mais de samouraïs.

Le Pays des Vagues est un pays relativement pauvre, situé sur une petite île, et qui n'a pas de village caché. Son économie est entièrement spoliée par des multinationales sans scrupules...